在胚胎初期，睾丸位于相当第二腰椎的两侧体腔内，从３个月至７个月逐渐下降至腹股沟部。睾丸下降过程伴随着腹膜鞘状突的生长和延长，大约在胚胎９个月时睾丸降入阴囊，而鞘状突闭鞘。但到出生时仍有１０％～１５％的人睾丸尚未降入到阴囊，其中大部分在生后一年内能自然降入阴囊。所以，１岁以内隐睾发生率为１％～２％，成人阶段其发病率为０。２％～０。３％。组织学研究表明，在５岁以内同正常位置睾丸无明显示差别；６～１０岁期间较正常位者生精细胞的发育没有太大的差别；而１０岁以后到青春期，睾丸容积减少，曲细精管管腔增厚，细胞变性，基底膜增厚，玻璃样变，导致不可逆性的生精功能障碍。若两侧隐睾，必然会出现生精障碍。而近年来逐渐认识到，在单侧隐睾时，对侧睾丸位置、大小形态正常时也会出现精子减少或畸形，成为不育的原因，临床上称此为互感性睾丸障碍。隐睾处，局部温度升高，严重影响睾丸的发育，生精或能异常，而睾丸间质细胞基本正常，雄性激素来源不减少，所以性器及副性征的发育基本正常。但近年来证实，５岁以后至青春期，较正常位置睾丸间质细胞的功能明显低下。因此，多数人主张，隐睾症者应在５岁以前手术为宜。隐睾症的合并症有以下几种：
①腹股沟疝。其主要原因是鞘状突没闭锁，发病率很高，Ⅲ度以上隐睾皆合并腹股沟疝。
②尿道下裂。隐睾症伴发尿道下裂者很多。
③睾丸肿瘤。关于隐睾并发肿瘤问题，多数泌尿科专家都认为较一般患者高。隐睾发生恶变比正常睾丸多３０～５０倍。特别是青春期以后发病率明显增高。可见，从预防睾丸肿瘤的观点，其手术时间应在５～１０岁，不能晚于１０岁。
④睾丸外伤。睾丸位于腹股沟管内，管壁坚韧无弹性，又近体表，易遭受损伤。
⑤睾丸扭抟。隐睾的病人易有睾丸或精索扭转。
⑥睾丸功能障碍。由于内环境改变或内分泌平衡失调，隐睾会发生组织改变，障碍精子生成。
⑦其他。合并睾丸囊肿、鞘膜积液、积血等。