先天因素即胎产因素，指小儿出生前已形成的病因。
遗传病因是先天因素的主要病因。调查表明，约1．3％的婴儿有明显的出生缺陷，即有先天畸形、生理缺陷或代谢异常，其中70％-80％为遗传因素所致。父母的有害基因是遗；传性疾病的主要病因，现代社会又增加了工农业及环境污染·，导致新的致畸、致癌与致突变的机会。已被认识的遗传性疾病达3500种以上，其中相当部分目前尚缺乏有效的治疗方法，或需要终生进行饮食及药物治疗。对于有碍优生的遗传性疾病基因携带者应劝其不结婚或不生育，这是提高人口质量的重要措施。
怀孕之后，若不注意养胎护胎，也易于造成先天性疾病。诸如孕妇营养不足、饮食失节、情志失调、劳逸不当、感受外邪、接触污物、遭受外伤、房事不节、患有疾病、用药犯忌等等因素，都可能损伤胎儿。分娩时难产、窒息、感染、产伤等，也会成为许多疾病的病因。《格致余论·慈幼论》说：“儿之在胎，与母同体，得热则俱热，得寒则俱寒，病则俱病，安则俱安。”说明了胎养因素与小儿健康的密切关系。